A bacia hidrográfica do Amazonas é a maior do mundo, ocupa uma área de mais do que 6.8 milhões de km2 e é cerca de duas vezes maior do que a bacia do Congo. A bacia amazônica inclui o rio Tocantins, localizado ao sul da foz do rio Amazonas, que apesar de alguns autores não o considerarem como parte dela, já que suas águas fluem para a Baía de Marajó, está conectado ecológica e geograficamente a ela.