The main commercial fishing area in the Amazon Basin has few major cataracts. Only those of the Rio Madeira and Rio Caquetá have been important for commercial fishing.
A maior parte da bacia amazônica está situada abaixo dos 300 metros de altitude e há pelos menos 40.000 km de rios navegáveis na Amazônia, o que dá uma boa idéia de como os rios são desobstruídos. As primeiras grandes cataratas dos 12 maiores rios da Amazônia, na direção a montante, estão situadas no rio Xingu, próximo ao estuário. As corredeiras do rio Xingu se localizam a apenas 150 km de sua foz e são uma importante barreira biogeográfica para os peixes. As espécies migradoras da planície amazônica não sobem as corredeiras e as espécies comerciais a montante são diferentes. Não há pesca relevante nas corredeiras.
As corredeiras mais importantes seguintes estão no rio Madeira. Estas se estendem por 360 km a montante de Porto Velho e são formadas por 16 cachoeiras que se localizam principalmente no Brasil, mas também na Bolívia. Embora as corredeiras do rio Madeira sejam uma barreira biogeográfica conhecida para muitos grupos de animais, como o peixe-boi da Amazônia, o tucuxi e vários grupos de peixes, inclusive o pirarucu gigante (Arapaima gigas) e os jaraquis (Semaprochilodus spp.), muitas espécies de peixes migradoras sobem por suas águas turbulentas durante os períodos de migração. A pesca de bagres migradores nas corredeiras do rio Madeira, especialmente na maior, a cachoeira de Teotônio, tem sido intensa desde o final dos anos 60. A dourada é a espécie mais importante e os equipamentos tradicionalmente utilizados em Teotônio para capturar os bagres migrando rio acima são a fisga (um tipo de gancho), tarrafa, rede de emalhar e linha e anzol. As maiores capturas em Teotônio ocorreram no início dos anos 70, quando o pescado era exportado para outras regiões do Brasil. Pescadores relatam que as dragas para a mineração de ouro ocuparam as corredeiras do rio Madeira durante a febre do ouro dos anos 80, impedindo as migrações de bagres e interrompendo as pescarias comerciais. Os pescadores também foram atraídos pelas atividades de mineração de ouro. A pesca em Teotônio diminuiu gradualmente devido a normas governamentais que restringem a pesca nas corredeiras e, com o represamento do rio pelas represas de Santo Antônio e Jirau, esta pescaria desapareceu completamente. Estas represas estão bloqueando as migrações dos peixes e ainda não está claro se as passagens de peixes construídas irão funcionar efetivamente. Os garimpos de ouro ainda continuam, mas estão localizados principalmente na Bolívia, próximos a última cachoeira do rio Madeira, a Cachuela de Esperanza.
Outras cachoeiras importantes para a pesca são as conhecidas por Chorro de Araracuara, no rio Caquetá, na Colômbia. As espécies mais importantes capturadas também são os grandes bagres migradores. Uma pequena indústria de peixes opera em La Pedrera, sendo a maior parte da produção desta pescaria exportada de avião para Bogotá. Os peixes são capturados por arpões, arremessados de cima de pedras ao longo das margens, ou com linha e anzol.
Existem outras cachoeiras na bacia amazônica que são explotadas por pescarias locais, mas apresentam pouca importância comercial. As pescarias nas cachoeiras do alto rio Negro ainda empregam várias técnicas indígenas, como currais e timbó que ainda são amplamente utilizados.
Ao contrário das pescarias comerciais em corredeiras, que geralmente exploram espécies maiores que 30 cm, os grupos indígenas, em geral, capturam espécies menores do que 5 cm de comprimento. Essas pescarias representam uma excelente forma de compreender não apenas a pesca indígena, como também os padrões de migração de peixes pequenos na Amazônia, que ainda são cientificamente pouco conhecidos
